Riqueza estimada (Chao1) e similaridade entre duas áreas
Cole as abundâncias de cada espécie em duas áreas e veja a riqueza observada, a riqueza estimada pelo Chao1 com correção de viés, as espécies em comum e os índices de Jaccard e de Sørensen.
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Como a riqueza e a similaridade são calculadas
Chao1 = S + (N − 1)/N × f1(f1 − 1) ÷ (2(f2 + 1)); Jaccard = comuns ÷ união; Sørensen = 2 × comuns ÷ (S da área A + S da área B)
Em levantamentos de campo, a riqueza observada costuma ficar abaixo da real, porque espécies raras escapam da amostra. O Chao1 com correção de viés usa os singletons (espécies com 1 indivíduo, f1) e os doubletons (com 2, f2) para estimar quantas espécies faltam. A ferramenta calcula a riqueza observada e a estimada de cada área, as espécies em comum e os índices de Jaccard e de Sørensen entre as duas.
Exemplo de duas áreas com oito espécies
| Espécie | Área A | Área B | Grupo |
|---|---|---|---|
| Sp1 | 12 | 7 | 3 |
| Sp2 | 1 | 0 | 1 |
| Sp3 | 1 | 3 | 3 |
| Sp4 | 2 | 0 | 1 |
| Sp5 | 5 | 5 | 3 |
| Sp6 | 0 | 1 | 2 |
| Sp7 | 0 | 2 | 2 |
| Sp8 | 4 | 0 | 1 |
Cuidados com o Chao1 e os índices
- S é o número de espécies com abundância maior que zero; N é o total de indivíduos da área.
- Esta é a forma com correção de viés, que não trava quando não há doubletons.
- Jaccard e Sørensen usam só presença e ausência; a abundância não pesa.
- O intervalo de confiança do Chao1 não é calculado.
Nota: Estimativa estatística com as contagens digitadas; depende da qualidade da amostragem.
Perguntas frequentes
Como estimar a riqueza de espécies com o Chao1?
Some às espécies observadas a correção dos singletons e doubletons. No exemplo, a área A tem 6 espécies observadas e 6,48 estimadas.
O que é o índice de Jaccard entre duas áreas?
É a razão entre as espécies comuns e todas as espécies das duas áreas: no exemplo, 0,375.
Qual a diferença entre Jaccard e Sørensen?
O Sørensen dá mais peso às espécies comuns; no exemplo vale 0,545, contra 0,375 do Jaccard.